El libro consta de 30 capítulos, divisibles en tres áreas: agentes y finalidad de la educación; formación intelectual; formación moral.

Su ideal educativo para la escuela de gramática (equivalente a la escuela media, previa a la Universidad), se fundamenta en las letras clásicas y en el afán por evitar los vicios. Se basa también en el esfuerzo del alumno, que conseguirá con disciplina y empeño sus propósitos en la escuela, auténtico gimnasio del espíritu, donde adquirirá la riqueza inmaterial, más deseable que cualquier otra por ser un tesoro preciado.

Agentes educativos

Los padres, como responsables de la educación de sus hijos desde su nacimiento, deben buscar maestros sabios para encomendarles su instrucción y formación moral. Interesa que sean, en primer lugar, personas de buenas costumbres y religiosas, con amplios conocimientos de las materias que enseñen. La educación de los hijos es un empeño e inversión de los padres; buscarán maestros doctos con moral intachable.

Es necesario que el maestro esté dotado no sólo de ciencia, sino otras condiciones intelectuales (concisión, agudeza y claridad) y hábitos morales buenos (humildad, sensatez, piedad, respetabilidad, afabilidad sin excesos, moderación al imponer castigos). El maestro debe estimar a todos los alumnos, sin dejarse llevar por preferencias o por la fortuna de sus padres.

Se muestra partidario de la escuela pública o abierta a grupos de alumnos, frente a la enseñanza mediante tutores o profesores particulares, aunque conoce casos satisfactorios en la enseñanza privada personal. La escuela es lugar de socialización y aprendizaje: facilita una sana competencia e iniciarse en el uso público de la palabra.

La comunidad cívica posee también una función pedagógica; mediante el buen ejemplo, los mayores facilitan la educación de los estudiantes, que corresponderán con respeto y deferencia, escuchando sus consejos. Los alumnos deben de comprender que la formación recibida posee una dimensión social: cada hombre debe ser útil para sus iguales.

Psicobiología

El maestro debe conocer el carácter de los alumnos para saber orientarles y comprenderles adecuadamente, siguiendo la estela de Plutarco y Quintiliano. Sin embargo, no realiza un estudio de los temperamentos, como Erasmo, ni alcanza los inicios de la pedagogía diferencial de Vives, Juan Huarte de San Juan, ni el determinismo pedagógico del doctor Andrés Laguna.

Reconoce el valor pedagógico del conveniente descanso y cierta diversión. Emplea el término juego con dos acepciones: como entretenimiento o distracción, unida a la actividad física y como recurso pedagógico en clase (acertijos, concursos, fábulas, etc.). Recomienda hacer ejercicio antes de comer, especialmente en el caso de los niños, cuya edad requiere acrecentar y reforzar su vigor. Entre los juegos nobles, aconseja los paseos y salidas al campo, la contemplación de las estrellas; el salto, la carrera, la lucha, la esgrima, la gimnasia, el aro, juegos con pelotas y balones, la natación y la música, el ajedrez y el juego de las damas.

La doctrina fungueriana sobre la salud, vincula la moderación, a cierto determinismo o influencia del medio ambiente en el carácter. Señala los lugares saludables para edificar las casas y las escuelas: sitios aireados y cerca de algún río, evitando los terrenos pantanosos o los valles encerrados; incluso considera que el clima influye en el temperamento. No comparte la teoría hipocrática de los humores.

Recomienda a sus alumnos mayor frugalidad en la comida vespertina, evitar totalmente el vino y trasnochar. Considera suficiente dormir siete horas, algo más en invierno. Armonía y vida de acuerdo con la naturaleza son principios muy acordes con el pensamiento humanista nórdico y su base estoica: el individuo debe buscar el equilibrio, la mesura, evitar extremos dañinos.

Métodos y currículo

Los profesores preferirán fomentar el encomio a los castigos, que siempre serán proporcionales a la edad y falta. Procurarán conocer las dotes y límites de sus pupilos, para sacar de ellos el máximo, mediante la disciplina y la virtud, tomando como modelo a los clásicos que han hecho historia por su valor o su obra escrita y de los ejemplos que como cristianos les proponga la Sagrada Escritura.

El maestro combinará paciencia y disciplina, partiendo de lo más sencillo para llegar a lo complejo; transmitirá la verdad, objeto de todas las ciencias; los alumnos corresponderán estudiando con ahínco para llenar de cultura la alacena de su memoria; aprenderán a leer en voz alta, para alejar el miedo escénico antes de iniciarse en el arte de la retórica siguiendo el modelo ciceroniano; el debate regulado será otra competencia necesaria; adquirirán soltura para hablar y escribir prosa y verso en latín, lengua vehicular de entonces, útil para aprender otras lenguas; secundariamente, conocerán también la lengua griega, alabada por el propio Cicerón, y materias propedéuticas para los estudios universitarios, como Historia, nociones de Derecho y Medicina.

Fungerio presenta una propuesta de currículo de estudios para una escuela de gramática a la que asisten, en un único local, alumnos de entre 7 y 14 años, con distintos niveles de conocimientos. Inicialmente se enseñará la gramática y sintaxis latina con ejercicios escritos en prosa y verso, traducción y declamación. Maestro y alumnos utilizarán siempre la lengua latina en la escuela. Para los más jóvenes recomienda los Diálogos de Erasmo, las Cartas de Cicerón y el teatro de Terencio. Para los mayores, a los poetas latinos Virgilio, Horacio y Ovidio, a los historiadores Tito Livio y Salustio e iniciación al griego, con Jenofonte, Isócrates, Homero, Hesíodo y Aristóteles.

Formación moral

Un tercio del De puerorum, se dedica a la formación moral de los jóvenes que, junto a la alusión a los preceptos bíblicos y los pecados capitales, se hacen presentes tradiciones éticas clásicas. Se aprecia un fondo platónico en dos sentidos: por una parte, se percibe el dualismo de los deseos del cuerpo frente al logos racional y, por otro lado, termina su tratado aludiendo a la metáfora del auriga, encargado de dirigir los apetitos sensibles. También se percibe la doctrina aristotélica sobre las pasiones, entendidas como afecciones del cuerpo y del alma, vinculadas al placer y al dolor. Funguerio hace suyos algunos de los postulados de la Ética a Nicómaco sobre este particular: el ser humano se enfrenta a la vida con valor, amor, piedad, emulación y gozo; pero también con deseo, cólera, temor, envidia y añoranza. Como no podía ser de otro modo, hay referencias a la ética ciceroniana y estoica: el vir bonus que aspirara a la sabiduría no podía dejarse llevar por las pasiones; para ejercer la actividad intelectual y seguir una vida recta debía conseguirse cierto otium, tiempo robado al negotium habitual, y llevar una existencia de acuerdo con la naturaleza, controlando toda pasión irracional hasta alcanzar la tranquilidad anímica o ataraxia. En el modelo de conducta moral que propone se perciben sus raíces clásicas y cristianas. Sigue concretamente el estoicismo de Cicerón y Séneca, retomado por Erasmo y radicalizado por Calvino. La suya es una moral del deber, voluntarista, que mantiene a raya el cuerpo en sentido positivo (actividad física y juegos, régimen de comidas, moderación en la bebida, horas de sueño, normas de saber estar y cortesía) y negativo (pasiones y vicios), teniendo este último mayor predicamento que la exhortación a la virtud.